Sciences de la vie et de la Terre

Fiche d’analyse du logiciel ANAGENE version 1.8

01 / 09 / 2005 | Sacha Touille | Jean-Claude Lehir

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  • LOGICIEL d’analyse de séquences nucléiques et protéiques permettant :
    1. Édition des séquences.
    2. Conversions diverses.
    3. Comparaison simple.
    4. Alignement avec discontinuité.
    5. Action d’enzymes de restriction.
  • Banque de données de séquences organisées en thèmes d’étude et accompagnée de documents d’appui.

Anagène1.8 représente la dernière version
du logiciel d’analyse de séquences nucléiques et protéiques déjà
présenté sur ce site.Vous pouvez consulter la fiche
réalisée à la sortie de la version 1.0 de ce logiciel.


Comparativement à la version 1.0, cette nouvelle version présente
des améliorations dans la continuité. Le logiciel est livré
sur support cédérom. La documentation complète est
incluse sous forme de fichier au format pdf et peut donc être plus
facilement exploitée pour la préparation des documents du
professeur.

Les points forts essentiels de cette version
sont une navigation plus ergonomique dans les ressources fournies qu’il
s’agisse de la banque de séquence, des thèmes ou encore
de la banque des enzymes de restriction.

Visuellement quelques détails ont
amélioré la lisibilité. C’est le cas des infobulles.
De nombreux pictogrammes renforcent la signalétique des divers
types de ressources en leur étant associés.

On perçoit bien également les
fins des séquences lorsqu’on les balaie en totalité.

Le repérage de la position d’un élément
comme un nucléotide, un radical aminoacyl dans une séquence
est beaucoup plus sûr maintenant, ce n’était vraiment pas
le cas avant !

La visualisation d’une position à
l’aide du grand curseur est très évidente puisqu’il s’est
agrandi jusqu’à atteindre les échelles. Les deux échelles
(pas de 1 pour les comptages sur les séquences nucléotidiques)
ou pas de 3 (pour les comptages sur les séquences protéiques)
ont pris des couleurs différentes. On aurait pu aller jusqu’à
les nommer, ce sera peut être pour la version suivante. Elle semble
d’ailleurs être en préparation puisqu’un nouveau module est
prévu mais non implémenté : le graphique de ressemblance.
On en trouve les fonctionnalités décrites dans l’aide.

L’intégration avec les ressources
sélectionnées au niveau de l’INRP est tout à fait
importante et enrichit sans cesse les possibilités d’intégration
de ce logiciel dans les démarches pédagogiques. L’accès
à la banque de séquences préparées et organisées
en thèmes correspondants aux points abordés par les programmes
en vigueur se fait directement à partir d’Anagène si la
machine est connectée à Internet. Vous pouvez la consulter
à l’adresse suivante : http://www.inrp.fr/Acces/biotic/ana...

C’est donc une version
majeure d’Anagène que le Scérén-Cndp vient de mettre
à notre disposition.

Post Scriptum :

Logiciel incontournable
en section scientifique

 

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