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Sciences de la vie et de la Terre

Rasmol : Mettre en valeur

01 / 09 / 2005 | Sacha Touille

<IMG src="http://svt.ac-creteil.fr/archives/rasmol/select.gif" ALT="Sélectionner" BORDER=0 HEIGHT=77 WIDTH=100>

SÉLECTIONNER , ISOLER

    CERTAINS ATOMES                

SÉLECTIONNER

ISOLER

Certains fichiers représentent des assemblages de molécules comme par exemple les différents monomères d’une protéine, une proteine et un ligand, une enzyme et un inhibiteur, une portion d’ADN et une enzyme de restriction (1eri.pdb par exemple), etc...

La sélection permet de faire subir un
traitement particulier à certains atomes afin de les mettre en valeur
par rapport aux autres .

Il peut être intéressant de masquer certaines parties de la molécule pour pouvoir porter l’étude sur la partie encore visible.

Une commande de restriction d’affichage permet
d’isoler certains atomes.

Utiliser :

Commencer par charger un fichier de description d’une molécule dans Rasmol (1eri.pdb par exemple) :

  • Cliquer sur

    File

    puis

    Open

    et choisir le
    fichier dans le répertoire voulu.

(voir ci dessus)

Pour réafficher la totalité
de la molécule , taper
select all

<IMG src="http://svt.ac-creteil.fr/archives/rasmol/flecheh.gif" BORDER=0 HEIGHT=39 WIDTH=33> <IMG src="http://svt.ac-creteil.fr/archives/rasmol/flechegh.gif" BORDER=0 HEIGHT=28 WIDTH=40>

 

 

  

 

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