Sciences de la vie et de la Terre

fiche CÈdÈrom Visualiser les molécules 3D avec Rasmol

01 / 09 / 2005 | Sacha Touille

VISUALISER
LES MOLÉCULES EN 3D
AVEC LE LOGICIEL RASMOL

Niveau Lycée Classes pépa, IUT
Type Prise en main, logiciel, banque de molécules
Auteur(s) Pierre Ducamp Jacqueline Taillard
Éditeur

CRDP d’Aquitaine crdp.ac-bordeaux.fr

Diffusion CRDP d’Aquitaine CNDP http://www.generation5.fr
Support Cédérom pour MAC et PC et fascicule

 

Ce fascicule et son cédérom sont organisés en 3 parties axées autour du logiciel, de la banque de molécules et d’exercices pour les 3 niveaux du Lycée

 

fr.gif (972 octets)Le fascicule et le cédérom présentent le logiciel de visualisation moléculaire en 3D RASMOL (version 2.6) d’usage international. Il figure sur le cédérom en 2 versions anglaise et française accompagnée de fiches de prise en main permettant une familiarition avec cet outil logiciel (lancement du logiciel, principales commandes de visualisation, sélection de portion de molécule, affichage des liaisons hydrogène et des ponts disulfure, impression, ...)

La banque moléculaire
contient 291 molécules classées en 23 catégories
selon leur fonction biologique ou leur nature. On y trouve entr’autre
 : les acides aminés et des protéines, les acides nucléiques,
des drogues, des médicaments et des toxiques, des hormones et des
récepteurs hormonaux, des lipides et des glucides, des molécules
illustrant l’évolution moléculaire ou à fonction
immunologique, des neurotransmetteurs, Une présentation de la structure
d’un fichier décrivant le modèle d’une molécule permet
de se rendre compte de quelle manière travaille le logiciel.

La troisième
partie comporte une série d’activités pédagogiques
réalisables à partir du logiciel et des molécules
de la banque adaptées à différentes situations d’apprentissage.
Les exercices conçus et diffusés sur Internet par divers
collègues apportent des informations pour le professeur et un questionnaire
pour l’élève. Ils couvrent les différents niveaux
du Lycée : Seconde, première S, Terminale S obligatoire
et spécialité. : molécule d’ADN, des acides aminés
à la protéine,spécificité d’une enzyme, hémoglobine
A et S, reconnaissance du soi et du non-soi, fonctionnement synaptique,
traitement contre la douleur, action d’un hypotenseur, action des enzymes
de restriction.
Des corrigés
sont disponibles.

 

fr.gif (972 octets)De nombreux documents relatifs à ce logiciel Rasmol, à ce modèles moléculaires et à leur mise en œuvre pédagogique existent depuis longtemps sur Internet : serveur BIOGEO de l’INRP, dans les serveurs académiques (par exemple sur le serveur SVT de Créteil consulter :"Activités de modélisation moléculaire". ou faire une recherche sur SPINOO.

La version française
ne diffère de l’anglaise que par la barre de menu qui est francisée.
En ce qui concerne la fenêtre « Command line » la syntaxe
des commandes est strictement la même. Cette version française
n’est intéressante que pour un usage limité aux visualisations
basiques permise par le logiciel.

Sans innover radicalement,
ce produit a l’avantage de rassembler cette collection classée
de molécules et toute une batterie d’exercices exploitables à
partir des fichiers au format Acrobat (pdf).

Avis du groupe
logobig.gif (1440 octets)
fr.gif (972 octets) Cédérom et fascicule très utiles pour le Lycée.
g_fr.gif (946 octets)<font face="Arial" size="2" color="#000080">Autres produits analysés

 

 

 

 

 

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