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Sciences de la vie et de la Terre

Modification du fichier de la proinsuline avec le Bloc-notes

01 / 09 / 2005 | Sacha Touille

Date :
mars 2004

{{}}<FONT face=Arial size=2>AUTEUR :
Frédéric LALEVÉE
<FONT face=Arial size=1>Lycée Jean rostand
93420 VILLEPINTE

Niveau concerné :

Lycée
Type
Fiche technique

Comment modifier des fichier PDB
pour isoler des molécules intéressantes
Modification du fichier de la proinsuline avec le Bloc-notes
Avertissement : il ne s’agit pas pour nous d’expliquer comment on construit un fichier pdb, mais de montrer comment, avec un nombre limité de manipulations simples, on peut arriver à afficher une molécule isolée.
Avant d’afficher le fichier dans le Bloc-notes, il est nécessaire d’en comprendre la structure, expliquée dans la page Modification du fichier de la proinsuline avec un éditeur HTML.
Afficher le fichier .htm dans le bloc-notes

Ouvrir le fichier
dans Internet Explorer, dérouler le menu modifier et choisir
Modifier avec le Bloc-notes.

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Le Bloc-notes ouvre le fichier rapidement, mais entièrement
en code HTML. C’est d’apparence assez compliquée pour ceux qui
ne connaissent pas ce code, mais il suffit d’y retrouver les lignes
de début et de fin des zones à supprimer.Voir ce qui
suit.

Ci-dessous, le début du code HTML, à ne pas toucher.
...interruption... Ci-dessous, on retrouve les mots full entry to disc (4° ligne), HEADER, TITLE,..., en bleu dans la page HTML.
...interruption... Ci-dessous, le début de la première structure (MODEL, ATOM...).
...interruption... Ci-dessous, le début de la deuxième structure (MODEL 2, ATOM 1,...).
...interruption... Ci-dessous, la fin de la 20° structure et la fin du code HTML

Dans le Bloc-notes, on supprime exactement les mêmes lignes que dans un éditeur HTML. Elles sont juste un peu plus difficiles à trouver. On supprime donc de la ligne full entry to disc (image 2) incluse à la ligne Modification du fichier de la proinsuline avec un éditeur HTML
Sommaire des fiches modification
Fiche présentation




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